疼く is read as うずく (uzuku) and means to rankle.
うずく
uzuku
古い傷が雨の日に疼く。
ふるいきずがあめのひにうずく。
That old wound aches on rainy days.
化膿したところがひどく疼く。
かのうしたところがひどくうずく。
The infected area aches badly.